Скорее всего, 95% страниц — служебные или «тонкие»: теги, архивы, страницы с 100 словами. РСЯ фильтрует их автоматически. Решение:
— закройте служебные страницы черезnoindex,
— объедините короткие статьи в гиды,
— добавьте минимум 500 уникальных слов в ключевые страницы.
После этого обновите sitemap в Вебмастере — через 3–7 дней покрытие вырастет.